Todo comienza cuando la Detective Rebecca Madsen (Sarah Jones, "Sons of Anarchy") del Departamento de Policía de San Francisco es enviada a investigar un homicidio en el que una huella digital la lleva hasta un sospechoso que había estado preso en Alcatraz y debería haber muerto hace décadas. Cuando el agente del gobierno Emerson Hauser (Sam Neill, "Jurassic Park") intenta impedir la investigación de la detective, Madsen busca ayuda en el experto en Alcatraz y fánáticos de los cómics, Dr. Diego "Doc" Soto (Jorge Garcia, "Lost").
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