A série é centralizado no Tenente Comandante Harmon "Ham" Rabb Jr. e na Tenente Coronel do Corpo de Marines Sarah "Mac" Mackenzie. A história tem início após Rabb sofrer um acidente de avião, é transferido para o Corpo Geral de Advogados e Juízes da Marinha, o JAG: Judge Advocate General, onde passa a defender, investigar com a mesma ousadia e persistência que fazia nos tempos em que ele era piloto. Ao mesmo tempo tenta descobrir o que aconteceu com seu pai que desapareceu sem deixar vestígios.
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