Soğuk Savaş dönemi sırasında bir Amerikan nükleer denizaltısı bilinmeyen bir düşmanın saldırısına uğrar ve deniz tabanına oturur. Amerikan donanması yakınlardaki bir petrol istasyonunun çalışanlarından olayın sebebini araştırmalarını ister ve onlara destek olarak bir özel ekip ve yüksek teknolojiyle donatılmış bir araştırma denizaltısı gönderir. Elde ettikleri veriler ve tespitleri sonucunda ekip, kazanın sebebinin dünya dışı varlıkların saldırısı olabileceği yargısına varır fakat araştırmalarını ilerletebilmek için "Abyss" adı verilen derin sualtı kanyonuna girmek zorundalardır.
